Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5OP48047 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5OP48047 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms