Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IQGAP1P46940 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IQGAP1P46940 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms