Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAGEA3P43357 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms