Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSR1P43307 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSR1P43307 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms