Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5C1P36542 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms