Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DMAP28067 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms