Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms