Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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