Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRCP08575 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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