Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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