Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKAP2O75563 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms