Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIN3BO75182 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms