Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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