Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALUO43852 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALUO43852 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALUO43852 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms