Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA3O43365 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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