Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms