Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRTO14522 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRTO14522 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRTO14522 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PTPRTO14522 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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