Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM38O00635 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM38O00635 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms