Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOBPA7XYQ1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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