Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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