Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
VWA8A3KMH1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms