Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD54BQ9Y620 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms