Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms