Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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