Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GALPQ9UBC7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GALPQ9UBC7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms