Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRBP1Q9P2E9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms