Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms