Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms