Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO5CQ9NQX4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms