Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms