Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB18Q9NP72 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms