Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLSPNQ9HAW4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms