Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOJQ9H4E5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms