Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP58Q9BVL2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms