Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAGR1Q9BTK6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms