Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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