Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NOTCH4Q99466 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NOTCH4Q99466 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms