Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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