Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms