Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BORCS6Q96GS4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms