Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RTP4Q96DX8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms