Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMARCE1Q969G3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms