Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCG3Q8WXD2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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