Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHTF18Q8WVB6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms