Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms