Protein–RNA interactions for Protein: Q86XS8

RNF130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130Q86XS8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF130Q86XS8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF130Q86XS8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms