Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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