Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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