Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms