Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD16Q68DU8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms